杨肇基（？－1630年）字太初，明朝沂州（今山东临沂）人。

杨肇基自幼有材力且勇武过人，成年后由武举袭指挥，历任征东平西防倭三镇总兵，提任沂州卫正指挥，经屡次提升，任大同总兵。

天启二年，徐鸿儒组织的白莲教反山东，连陷巨野、郓城、汶上、费县、滕县，众至数万，朝庭着令杨肇基率大军迎敌，杨肇基须发皆白，仍是精神抖擞，率大军剿灭了反贼，立下大功。

崇祯初年，因功加官锦衣卫千户，授五花封诰，左都督、大将军、正一品，军中病故后追赠为太傅太师，谥号“武襄”

，葬娘娘庙东。

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